MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 11129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	GGC	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546000
2	NC_011366	CGC	2	6	195	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
3	NC_011366	TCG	2	6	260	265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
4	NC_011366	GTC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
5	NC_011366	GCC	2	6	385	390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
6	NC_011366	TC	3	6	525	530	0 %	50 %	0 %	50 %	209546000
7	NC_011366	GCC	2	6	620	625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
8	NC_011366	G	6	6	657	662	0 %	0 %	100 %	0 %	209546000
9	NC_011366	AAG	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546000
10	NC_011366	AAG	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546000
11	NC_011366	CGT	2	6	834	839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
12	NC_011366	GTC	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
13	NC_011366	GCC	2	6	971	976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
14	NC_011366	GCA	2	6	999	1004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546000
15	NC_011366	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
16	NC_011366	CCT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546001
17	NC_011366	CGC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546001
18	NC_011366	CCGT	2	8	2070	2077	0 %	25 %	25 %	50 %	209546001
19	NC_011366	TAG	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546001
20	NC_011366	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546001
21	NC_011366	TCG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546001
22	NC_011366	AAG	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546001
23	NC_011366	TTGAT	2	10	2335	2344	20 %	60 %	20 %	0 %	209546001
24	NC_011366	C	6	6	2882	2887	0 %	0 %	0 %	100 %	209546002
25	NC_011366	TGG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546002
26	NC_011366	GAG	3	9	2937	2945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
27	NC_011366	CGTC	2	8	2971	2978	0 %	25 %	25 %	50 %	209546002
28	NC_011366	TCAA	2	8	2995	3002	50 %	25 %	0 %	25 %	209546002
29	NC_011366	TCG	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546002
30	NC_011366	CGC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546002
31	NC_011366	GC	3	6	3125	3130	0 %	0 %	50 %	50 %	209546002
32	NC_011366	ATTG	2	8	3278	3285	25 %	50 %	25 %	0 %	209546002
33	NC_011366	GCG	2	6	3292	3297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546002
34	NC_011366	TAC	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546002
35	NC_011366	G	6	6	3357	3362	0 %	0 %	100 %	0 %	209546002
36	NC_011366	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
37	NC_011366	ATC	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546002
38	NC_011366	TTG	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546002
39	NC_011366	CA	3	6	3649	3654	50 %	0 %	0 %	50 %	209546002
40	NC_011366	GCA	2	6	3690	3695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
41	NC_011366	GGA	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
42	NC_011366	A	8	8	3758	3765	100 %	0 %	0 %	0 %	209546002
43	NC_011366	GAG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
44	NC_011366	CGA	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
45	NC_011366	TCT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546002
46	NC_011366	GC	3	6	4265	4270	0 %	0 %	50 %	50 %	209546002
47	NC_011366	CAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
48	NC_011366	CCG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546002
49	NC_011366	AT	3	6	4417	4422	50 %	50 %	0 %	0 %	209546002
50	NC_011366	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546002
51	NC_011366	TCT	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546002
52	NC_011366	CGA	3	9	4805	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
53	NC_011366	TGA	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546002
54	NC_011366	CAA	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546002
55	NC_011366	ACG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
56	NC_011366	CCG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
57	NC_011366	CGG	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
58	NC_011366	GC	3	6	5169	5174	0 %	0 %	50 %	50 %	209546003
59	NC_011366	GC	3	6	5189	5194	0 %	0 %	50 %	50 %	209546003
60	NC_011366	CTG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
61	NC_011366	TTG	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546003
62	NC_011366	TGC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
63	NC_011366	CGA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
64	NC_011366	TCGGC	2	10	5320	5329	0 %	20 %	40 %	40 %	209546003
65	NC_011366	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
66	NC_011366	CGG	2	6	5362	5367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
67	NC_011366	CATCGC	2	12	5392	5403	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209546003
68	NC_011366	GCC	2	6	5414	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
69	NC_011366	GCTT	2	8	5435	5442	0 %	50 %	25 %	25 %	209546003
70	NC_011366	GCGG	2	8	5489	5496	0 %	0 %	75 %	25 %	209546003
71	NC_011366	CGG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
72	NC_011366	TGC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
73	NC_011366	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
74	NC_011366	GCT	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
75	NC_011366	CAG	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
76	NC_011366	CTT	2	6	5636	5641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546003
77	NC_011366	GTC	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
78	NC_011366	CCT	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546003
79	NC_011366	CCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546003
80	NC_011366	GGC	3	9	5690	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
81	NC_011366	GAC	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
82	NC_011366	GCA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
83	NC_011366	CGC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
84	NC_011366	GCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
85	NC_011366	GCG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
86	NC_011366	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546003
87	NC_011366	GCC	2	6	5828	5833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
88	NC_011366	GC	3	6	5852	5857	0 %	0 %	50 %	50 %	209546003
89	NC_011366	TCG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
90	NC_011366	ACG	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
91	NC_011366	CGC	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
92	NC_011366	CCGG	2	8	5926	5933	0 %	0 %	50 %	50 %	209546003
93	NC_011366	GCC	2	6	5957	5962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
94	NC_011366	GTTT	2	8	5986	5993	0 %	75 %	25 %	0 %	209546003
95	NC_011366	AAG	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546003
96	NC_011366	CAT	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
97	NC_011366	ACG	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
98	NC_011366	ATC	3	9	6089	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
99	NC_011366	GCG	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
100	NC_011366	CG	3	6	6171	6176	0 %	0 %	50 %	50 %	209546004
101	NC_011366	TGC	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
102	NC_011366	CCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546004
103	NC_011366	CGG	2	6	6258	6263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
104	NC_011366	GATC	2	8	6333	6340	25 %	25 %	25 %	25 %	209546004
105	NC_011366	TCA	2	6	6348	6353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
106	NC_011366	GCCTGC	2	12	6404	6415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546004
107	NC_011366	GAC	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
108	NC_011366	CG	3	6	6453	6458	0 %	0 %	50 %	50 %	209546004
109	NC_011366	GTC	2	6	6487	6492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
110	NC_011366	ACC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
111	NC_011366	GCC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
112	NC_011366	GAT	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546004
113	NC_011366	GAC	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
114	NC_011366	AT	3	6	6635	6640	50 %	50 %	0 %	0 %	209546004
115	NC_011366	CGC	2	6	6654	6659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
116	NC_011366	GCCG	2	8	6666	6673	0 %	0 %	50 %	50 %	209546004
117	NC_011366	GCA	3	9	6732	6740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
118	NC_011366	CGA	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
119	NC_011366	CGG	3	9	6784	6792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
120	NC_011366	CGC	3	9	6798	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
121	NC_011366	CAC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
122	NC_011366	TGC	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
123	NC_011366	CCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
124	NC_011366	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
125	NC_011366	GAC	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
126	NC_011366	TCA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546005
127	NC_011366	AGA	2	6	6953	6958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
128	NC_011366	CGA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
129	NC_011366	GAA	2	6	7047	7052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
130	NC_011366	GC	3	6	7073	7078	0 %	0 %	50 %	50 %	209546005
131	NC_011366	GAC	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
132	NC_011366	GC	3	6	7104	7109	0 %	0 %	50 %	50 %	209546005
133	NC_011366	CGA	3	9	7113	7121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
134	NC_011366	GGT	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546005
135	NC_011366	TCT	2	6	7130	7135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546005
136	NC_011366	CGC	2	6	7196	7201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546005
137	NC_011366	CG	3	6	7334	7339	0 %	0 %	50 %	50 %	209546005
138	NC_011366	CCG	2	6	7406	7411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546005
139	NC_011366	CAGC	2	8	7455	7462	25 %	0 %	25 %	50 %	209546005
140	NC_011366	GAA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
141	NC_011366	ACC	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546005
142	NC_011366	GAC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
143	NC_011366	ATC	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546005
144	NC_011366	CGGCA	2	10	7614	7623	20 %	0 %	40 %	40 %	209546005
145	NC_011366	GC	3	6	7678	7683	0 %	0 %	50 %	50 %	209546005
146	NC_011366	AGC	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
147	NC_011366	AGC	2	6	7723	7728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
148	NC_011366	CCG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546005
149	NC_011366	CGA	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
150	NC_011366	CGA	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
151	NC_011366	GCC	2	6	7941	7946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
152	NC_011366	GC	3	6	7948	7953	0 %	0 %	50 %	50 %	209546006
153	NC_011366	CGA	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
154	NC_011366	CG	3	6	8034	8039	0 %	0 %	50 %	50 %	209546006
155	NC_011366	CCGC	2	8	8040	8047	0 %	0 %	25 %	75 %	209546006
156	NC_011366	ACG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
157	NC_011366	CGG	2	6	8081	8086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546006
158	NC_011366	CTG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546006
159	NC_011366	GCA	2	6	8135	8140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
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164	NC_011366	ATCG	2	8	8235	8242	25 %	25 %	25 %	25 %	209546006
165	NC_011366	CGA	2	6	8264	8269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
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167	NC_011366	GAC	2	6	8367	8372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
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172	NC_011366	CCG	2	6	8519	8524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
173	NC_011366	GC	3	6	8536	8541	0 %	0 %	50 %	50 %	209546006
174	NC_011366	GCCG	2	8	8559	8566	0 %	0 %	50 %	50 %	209546006
175	NC_011366	GCC	2	6	8598	8603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
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178	NC_011366	ATCC	2	8	8669	8676	25 %	25 %	0 %	50 %	209546006
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189	NC_011366	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546006
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245	NC_011366	CAGT	2	8	11292	11299	25 %	25 %	25 %	25 %	209546008
246	NC_011366	GGCAG	2	10	11321	11330	20 %	0 %	60 %	20 %	209546008
247	NC_011366	TCG	2	6	11363	11368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546008
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251	NC_011366	GC	3	6	11457	11462	0 %	0 %	50 %	50 %	209546008
252	NC_011366	CAG	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546008
253	NC_011366	GC	4	8	11593	11600	0 %	0 %	50 %	50 %	209546008
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256	NC_011366	GTT	2	6	11717	11722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546009
257	NC_011366	TCG	2	6	11745	11750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546009
258	NC_011366	GTC	2	6	11795	11800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546009
259	NC_011366	CGT	2	6	11920	11925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546009
260	NC_011366	GTCGCC	2	12	11948	11959	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546009
261	NC_011366	AGC	2	6	11980	11985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546009
262	NC_011366	GCGTC	2	10	11991	12000	0 %	20 %	40 %	40 %	209546009
263	NC_011366	AG	3	6	12015	12020	50 %	0 %	50 %	0 %	209546009
264	NC_011366	CAGTC	2	10	12054	12063	20 %	20 %	20 %	40 %	209546009
265	NC_011366	GGC	2	6	12080	12085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546009
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270	NC_011366	CAT	2	6	12227	12232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546009
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273	NC_011366	GT	4	8	12264	12271	0 %	50 %	50 %	0 %	209546009
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279	NC_011366	GCT	2	6	12566	12571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546010
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282	NC_011366	CGC	2	6	12669	12674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546010
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372	NC_011366	GGC	2	6	16557	16562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546015
373	NC_011366	AGA	2	6	16574	16579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546015
374	NC_011366	TCA	2	6	16583	16588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546015
375	NC_011366	GGC	2	6	16594	16599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546015
376	NC_011366	ACCGGC	2	12	16600	16611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546015
377	NC_011366	GAC	2	6	16614	16619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546015
378	NC_011366	CAT	2	6	16662	16667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546015
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380	NC_011366	GCG	2	6	16754	16759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546015
381	NC_011366	TCG	2	6	16783	16788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546015
382	NC_011366	CAT	2	6	16809	16814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546015
383	NC_011366	CGG	2	6	16830	16835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546015
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385	NC_011366	GC	3	6	16980	16985	0 %	0 %	50 %	50 %	209546015
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